En línea con los fines genéricos que debe perseguir todo Colegio Mayor según lo dispuesto en la legislación vigente, el Colegio Mayor San Agustín tiene los siguientes objetivos:

• Proporcionar a los colegiales un alojamiento con las instalaciones apropiadas que garanticen las condiciones óptimas para su estancia durante su etapa de formación universitaria.
• Generar el ambiente de estudio que favorezca un buen rendimiento académico.
• Facilitar los medios necesarios para lograr una formación humana que integre tanto el aspecto social y político como el ético y religioso.
• Impulsar la colaboración en la vida del Colegio Mayor y potenciar un clima de convivencia interna basado en el respeto, la tolerancia y la responsabilidad.
• Gestionar la organización de actividades científicas y culturales que complementen la formación académica impartida en la Universidad.
• Promover actividades deportivas dentro del Colegio Mayor y facilitar a los colegiales su participación en las que tengan lugar fuera del mismo.
• Ofrecer a los colegiales vías para encauzar sus inquietudes solidarias con actividades de voluntariado, bien propias, bien conjuntas con otros Colegios Mayores.
• Colaborar en el desarrollo de las inquietudes religiosas y en la búsqueda de fe de quienes lo deseen, desde la libertad y el respeto personal.
• Favorecer las relaciones con las Instituciones Universitarias, con los demás Colegios Mayores y Residencias Universitarias.
• Procurar que los colegiales adquieran y desarrollen, en un entorno de libertad, actitudes propias del espíritu de este Colegio Mayor , tales como el compromiso, el compañerismo, el diálogo y la solidaridad.